Xenium仪器
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✦Xenium技术原理
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Xenium技术核心原理为“探针杂交-信号放大-成像解码”：先将固定组织切片与带barcode的挂锁式探针杂交捕获目标RNA，经酶促环化生成环状DNA，后通过滚环扩增形成滚环扩增产物，在Xenium仪器中与荧光探针进行多轮杂交成像，通过荧光信号组合识别基因，将基因表达与组织形态精准对应，生成原位分析数据。
Xenium的技术原理
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✦Xenium实验流程
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Xenium的实验流程可以概括为五步，即：组织切片的准备、探针杂交&探针连接和扩增、染色、荧光探针杂交&成像和解码、数据可视化。
Xenium的实验流程
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✦Xenium技术优势
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1)分辨率：亚细胞级（0.2μm/像素）；
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✦Xenium适用样本类型
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新鲜冷冻样本（FF）和石蜡包埋样本（FFPE）；
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✦Xenium数据分析
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Xenium数据高阶分析内容包括降维聚类、细胞类型注释、细胞类型空间定位、GSVA功能富集分析、基因集打分、细胞间距离分析、细胞邻域分析等[1]。
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✦Xenium服务流程
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✦Xenium应用案例
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期刊：Cancer Cell
年份：2025年3月
影响因子：44.5
研究背景：食管癌是中国人群中常见的高发恶性肿瘤，其每年新发病例数占全球总量的 53%，而5年生存率仅不足30%。因此，做到早发现、早诊断、早治疗，对于降低食管癌的发病率与死亡率具有关键意义。
研究方法：研究团队借助Xenium技术，对43名患者的127份食管癌变多阶段组织样本展开系统分析，成功构建出全球首个食管癌变多阶段单细胞空间动态图谱。
研究结果：
1：研究团队利用 Xenium 原位检测等技术，分析了43名患者127个多阶段食管组织样本（涵盖正常食管上皮NOR、低级别上皮内瘤变LGIN、高级别上皮内瘤变HGIN、食管癌ESCC），构建了全球首个食管鳞癌单细胞多阶段空间动态演化图谱，系统呈现了ESCC发生发展过程中的细胞组成、基因表达及空间分布变化。
2：HGIN阶段侵袭性上皮细胞通过JAG1-NOTCH1信号激活邻近CAF，形成免疫抑制性生态位，促进肿瘤免疫逃逸与ECM重塑。
参考文献：
[1] Chang J, Lu J, Liu Q, et al. Single-cell multi-stage spatial evolutional map of esophageal carcinogenesis. Cancer Cell. 2025;43(3):380-397.e7. doi:10.1016/j.ccell.2025.02.009
