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空间多组学再获殊荣,曙光照亮临床转化之路!

2024-01-17

2023年12月6日,空间多组学被Nature Methods杂志评选为2023年度最值得期待的技术之一,是继2022年被Nature杂志称为最值得期待的技术之一后再获年度殊荣!


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图 1.  Nature Method文章截图


随着生物体发展进化过程,空间信息的缺乏往往使得单个细胞在组织中如何执行功能无法被揭示,因此分析胞内的功能状态对胞外及周围环境显得格外必要。先进的空间多组学可以帮助识别新的细胞亚型,局部观察细胞内和细胞间分子相互作用。从染色质到表型,从DNA到代谢,多组学方法旨在联合基因组、表观组、蛋白质组及代谢组的信息,拓宽我们对机制关系的认识,揭示细胞功能所必需的分子作用,构建可持续发展的疾病精准医疗方案。


空间多组学技术全面助力人类组织图谱解析




今年 6 月份,Nature发布迄今为止最详细、最全面的人类乳腺细胞图谱,空间多组学技术全面助力人类组织图谱解析。研究利用单细胞/单核/空间转录组和多重免疫组化(mIHC)技术鉴定出人类 12 种主要的细胞类型,描绘 58 种不同的细胞状态,并对具体的细胞类型和细胞间的相互作用进一步解析,详细描绘乳腺组织中各细胞亚型的细胞状态和空间联络,为深入理解乳腺组织的解剖生物学特征和疾病治疗提供全面的理论依据。


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图 2.乳腺组织中主要细胞类型的空间组学分析



艾克发生物mIHC和RNA-ISH强强联合


RNA 和蛋白的空间分布对于确定蛋白质在组织中的准确定位和功能至关重要,其可随着细胞类型、细胞周期进展、疾病状态和诊疗方法的变化而改变。通过不同组学实现生物标志物与空间位置的一一对应,获得更高维度和更高分辨率的表达图谱,全面解析组织微环境,以便提供精确诊断和治疗的方案。


艾克发生物于12月初推出AlphaXISH® 新一代RNA 原位杂交试剂盒后,升级mIHC方案,实现 mIHC和RNA-ISH两大技术强强联合,可在同一张切片上可同时获得 RNA 和蛋白水平的原位信息,单细胞分辨率下检测、表征和分析,获得真正的空间多组学信息,详细展示细胞邻域和组织微环境,在真实的组织空间背景下深入洞察细胞间相互作用、细胞通讯和细胞状态,发现有关肿瘤问题的关键机制,从而实现在临床上的大规模应用。
该方案可应用于肿瘤免疫、神经科学、细胞和基因治疗、传染病、炎症等领域,检测靶细胞中的非编码 RNA,识别分泌蛋白的细胞来源,检测特定细胞的高度同源转录本、可变剪接体等,进行RNA-蛋白表达相关性分析等。


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图3. 单细胞原位空间多组学整体解决方案

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图 4. RNA 双标 + 蛋白三标共染视野图


今年针对mIHC的临床转化有两个利好政策:一个是6月底江苏省出台了新增医疗服务价格项目,其中包括免疫组织化学多重抗体染色(项目编码:270500002-d);另一个是9月底《全国医疗服务项目技术规范(2023年版)》中,将“病理标本免疫荧光检测”、“病理标本多色免疫荧光检测”、“数字化常规病理切片扫描”及“数字化荧光病理切片扫描”正式列入国家级医疗服务收费项目名单,标志着mIHC及病理智能分析在国家层面得到了认可和强有力支持(参考链接)。这加速了mIHC在病理科实现落地,赋能临床实践的发展,进而推动医院、企业、患者三方共赢。

基于蛋白组学的生物标志物策略蓄力正确前进中。2023年11月28日,开发精准肿瘤药物的公司Acrivon Therapeutics宣布 FDA 已授予 ACR-368 OncoSignature 卵巢癌突破性医疗器械认定[3],基于mIHC检测来识别可能受益于ACR-368治疗的卵巢癌患者。早在今年5月份该公司ACR-368的II 期临床试验就被FDA授予两项快速通道认定,用于治疗卵巢癌和子宫内膜癌。Acrivon创始人认为,基于蛋白组学的技术将很快发展成为癌症患者应答者分层的黄金标准。

空间多组学的曙光已照亮临床转化之路。空间多组学将革新病理学技术,应用于临床诊断、精准诊疗等更广阔的场景,在未来几年实现从科研向临床的转化。根据DeciBio 和摩根大通的市场报告,空间多组学在 2022 年的全球市场规模已达 150 亿美元,当应用于临床市场后,其空间将呈爆炸式增长。

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